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La clasificación tradicional de los seres vivos reconoce cuatro grandes reinos entre los eucariotas: animales, plantas, hongos y protistas. Sin embargo, el descubrimiento del proceso evolutivo y los estudios de filogenia han demostrado las carencias de este sistema clásico de clasificación. Por ejemplo, la levadura de la cerveza, el alga diatomea y el plasmodio de la malaria se incluían, por su condición unicelular, en el amplio grupo ‘cajón de sastre’ de los protistas, aunque en realidad, la levadura está más cerca de los hongos, la diatomea de las plantas, y el plasmodio de los animales. De hecho, se consideran tres grupos distintos, las algas—próximas a las plantas—, los hongos unicelulares —próximos a los hongos verdaderos— y los protozoos —próximos a los animales—.
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